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通过宏基因组二代测序法鉴定急性肝衰竭患者

通过宏基因组二代测序法对急性肝衰竭患者的血清样本进行病毒监测

ViralSurveillanceinSerumSamplesfromPatientswithAcuteLiverFailurebyMetagenomicNext-GenerationSequencing

期刊：《ClinicalInfectiousDiseases》时间：年７月IF：8.2

研究背景

　　急性肝衰竭是多种因素引起的严重肝脏损害。引起肝衰竭的主要病因有肝炎病毒、药物及肝毒性物质（如乙醇、化学制剂）等。据统计，在急性肝衰竭(ALF)病例中，有12%ALF患者无法明确具体病因。针对ALF患者的病毒感染，传统的病毒鉴定方法对一些不易扩增的病毒或者和已知病毒序列保守性很低的新病毒的鉴定无能为力。

　　而借助于高通量测序技术快速发展起来的宏基因组学方法，不需要对病毒进行培养，且在未知病毒序列的情况下可以直接以环境样本中所有病毒的遗传物质为研究对象，快速地鉴定出样本中的所有病毒组成，因此在病原体检测中发挥着越来越重要的作用。

研究目的

　　从病因不明的急性肝衰竭(ALF)病例中筛查病毒。

研究结果

　　针对年到年收集到的名成年急性肝衰竭（ALF）患者，其中为未知病毒感染，17个患者为已知甲肝病毒（HAV）或乙肝病毒（HBV）感染；取患者血清样本进行宏基因组二代测序（mNGS）。

得到结果如下：

1、通过宏基因组二代测序鉴定出了8个新病毒感染病例，分别为单纯性疱疹病毒、HBV、细小病毒B19、巨细胞病毒、人类7型疱疹病毒；

2、鉴定出一些之前未被检测出的双重或三重感染，并且组装后的病毒基因组提供了额外的基因型及耐药性突变信息。

　　作者在文章结论中建议道，多数病因不明的急性肝衰竭患者可能并不是由于新型病毒感染导致，在对急性肝衰竭患者进行病毒检测时，应注意对罕见病毒或者多重病毒感染的筛查，而宏基因组二代测序对于病原体检测和病因排除是一个综合且有效的手段。

市场部李朦文案

潘旭兰编辑

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